El FC Cartagena compite en esta temporada en el Grupo II de la Segunda División «B». Además, participa en la Promoción de Ascenso a Segunda División.
TEMPORADA 2008-2009
Plantilla – Clasificación – Resumen
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SEGUNDA DIVISIÓN 'B' GRUPO II
| Sáb 30 Ago, 21:00 | H |  | CD Leganés | 3 - 1 |
| Dom 07 Sep, 12:00 | A |  | Atlético Madrileño | 1 - 2 |
| Dom 14 Sep, 12:00 | H |  | Las Palmas Atlético | 1 - 0 |
| Dom 21 Sep, 17:00 | A |  | CF Atlético Ciudad | 0 - 2 |
| Mié 24 Sep, 18:00 | A |  | Universidad de LPGC CF | 0 - 0 |
| Dom 28 Sep, 17:00 | H |  | UD Lanzarote | 1 - 1 |
| Dom 05 Oct, 16:30 | A |  | CDA Navalcarnero | 1 - 0 |
| Dom 12 Oct, 17:00 | H |  | UD Pájara | 1 - 0 |
| Dom 19 Oct, 11:00 | A |  | UD Vecindario | 2 - 2 |
| Dom 26 Oct, 17:00 | H |  | Sangonera Atlético CF | 1 - 0 |
| Dom 02 Nov, 17:00 | A |  | CD Alfaro | 0 - 0 |
| Dom 09 Nov, 17:00 | H |  | Real Murcia CF «B» | 2 - 0 |
| Dom 16 Nov, 17:00 | A |  | Lorca Deportiva CF | 1 - 1 |
| Dom 23 Nov, 17:00 | H |  | Águilas CF | 3 - 0 |
| Dom 30 Nov, 17:00 | A |  | AD Alcorcón | 3 - 2 |
| Dom 07 Dic, 17:30 | H |  | Real Madrid Castilla | 1 - 0 |
| Dom 14 Dic, 12:00 | A |  | UD Fuerteventura | 0 - 2 |
| Sáb 20 Dic, 17:00 | H |  | Mérida UD | 2 - 2 |
| Dom 04 Ene, 11:00 | A |  | UD Villa de Santa Brígida | 1 - 1 |
| Dom 11 Ene, 12:00 | A | | CD Leganés | 2 - 1 |
| Dom 18 Ene, 12:00 | H | | Atlético Madrileño | 1 - 0 |
| Dom 25 Ene, 11:00 | A | | Las Palmas Atlético | 2 - 3 |
| Dom 01 Feb, 17:30 | H | | CF Atlético Ciudad | 1 - 1 |
| Dom 08 Feb, 12:00 | H | | Universidad de LPGC CF | 4 - 0 |
| Dom 15 Feb, 11:00 | A | | UD Lanzarote | 1 - 4 |
| Dom 22 Feb, 17:00 | H | | CDA Navalcarnero | 1 - 1 |
| Dom 08 Mar, 12:00 | H | | UD Vecindario | 1 - 1 |
| Dom 15 Mar, 17:15 | A | | Sangonera Atlético CF | 2 - 1 |
| Sáb 21 Mar, 17:30 | H | | CD Alfaro | 1 - 0 |
| Mié 25 Mar, 16:30 | A | | Real Murcia CF «B» | 0 - 0 |
| Dom 29 Mar, 17:30 | H | | Lorca Deportiva CF | 0 - 1 |
| Mié 01 Abr, 18:00 | A | | UD Pájara | 0 - 2 |
| Dom 05 Abr, 17:30 | A | | Águilas CF | 0 - 2 |
| Dom 12 Abr, 18:00 | H | | AD Alcorcón | 1 - 1 |
| Dom 19 Abr, 17:00 | A | | Real Madrid Castilla | 0 - 1 |
| Dom 26 Abr, 18:00 | H | | UD Fuerteventura | 3 - 1 |
| Dom 03 May, 18:00 | A | | Mérida UD | 1 - 1 |
| Dom 10 May, 12:00 | H | | UD Villa de Santa Brígida | 5 - 1 |
PROMOCIÓN DE ASCENSO A SEGUNDA DIVISIÓN
| Dom 17 May, 19:00 | H |  | CD Alcoyano | 2 - 1 |
| Dom 24 May, 19:00 | A | | CD Alcoyano | 2 - 2 |
| Dom 31 May, 19:00 | H |  | Cádiz CF | 1 - 2 |
| Sáb 06 Jun, 19:30 | A | | Cádiz CF | 1 - 1 |
Partidos amistosos y de pretemporada.
26/07/2008. FC Cartagena 2-0 Cartagena FC. Goles de Koeman y Txiqui.
02/08/2008. FC Cartagena 1-1 UD Almería. Gol de Juan Pablo.
06/08/2008. CD Pozo Estrecho 0-5 FC Cartagena. Goles de Juan Pablo (2), Mantecón, Toledo y Koeman.
10/08/2008. FC Cartagena 1-1 Real Murcia CF. Gol de Juan Pablo.
13/08/2008. Orihuela CF 1-2 FC Cartagena. Goles de Toledo y Juan Pablo.
16/08/2008. FC Cartagena 1-1 Hércules CF – CARABELA DE PLATA. Gol de Juan Pablo.
20/08/2008. Ontinyent CF 2-1 FC Cartagena. Gol de Koeman.
23/08/2008. CD Cieza 0-3 FC Cartagena. Goles de Mena (2) y Carmona.
07/01/2009. FC Cartagena 4-0 RSC Anderlecht. Goles de Mariano Sánchez, Héctor Yuste, Juan Pablo y Viyuela.
04/02/2009. FC Cartagena 0-2 FC Copenhague.